Consortium canadien de recherche en épigénétique, environnement et santé

Le Consortium canadien de recherche en épigénétique, environnement et santé (CCREES) appuie la recherche de pointe sur le rôle de l'ADN et des interactions environnementales sur la santé et la maladie humaines. Cette initiative assurera au Canada un rôle de premier plan en épigénétique par la mise en application des découvertes.

Le CCREES travaille en partenariat avec la plupart des instituts des IRSC et est codirigé par les instituts suivants :

  • Neurosciences, santé mentale et toxicomanies
  • Génétique
  • Cancer

Parmi ses partenaires externes figurent notamment Genome BC, Génome Québec, Génome Canada et le Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS). Le CCREES établit actuellement des collaborations avec des organismes de financement et des intervenants pour améliorer la recherche dans ce domaine.

Aperçu

Introduction

L'épigénétique est l'étude des changements de la régulation de l'activité et de l'expression des gènes indépendante d'une altération de la séquence d'ADN. Le rôle de facteurs environnementaux particuliers liés à la régulation épigénétique de l'empreinte génétique est de plus en plus manifeste dans des problèmes complexes comme l'asthme, le diabète, les dépendances, la schizophrénie, les maladies inflammatoires intestinales et la majorité des cancers. L'épigénétique offre un modèle convaincant des effets durables, voire multigénérationnels, des influences de l'environnement sur la santé.

Au Canada, la capacité de recherche et l'expertise technique en épigénétique de calibre mondial se retrouvent au sein de noyaux d'excellence isolés. Les IRSC ont donc créé cette initiative phare de leur plan stratégique pour unifier ces noyaux et s'assurer que le Canada joue un rôle de premier plan dans un domaine considéré comme une seconde révolution en génétique. L'épigénétique promet d'approfondir les connaissances sur la nature de la santé et de la maladie.

Principaux besoins de recherche

Un des principaux besoins de recherche relevés par le CCREES est le manque de capacité de recherche en épigénomique. Le CCREES tire parti de l'infrastructure existante de séquençage génomique en développant une capacité de recherche spécialisée en épigénétique, centrée sur la santé et la maladie. Le CCREES sera donc en mesure de propulser la recherche canadienne en épigénétique au premier plan du Consortium international de l'épigénome humain (CIEH) (en anglais seulement). Le CIEH cherche à coordonner les cartes de l'épigénome humain pour des états cellulaires clés pertinents par rapport à la santé et à la maladie.

Il est essentiel d'appuyer la recherche innovante qui associe les marques épigénétiques à la santé et à la maladie, ce qui exige des approches multidisciplinaires intégrant tous les niveaux de recherche et de compréhension de la santé. Cela suppose de combler les besoins de connaissances fondamentales en créant, de façon ciblée, des outils et des diagnostics moléculaires hautement sélectifs.

Objectifs et résultats escomptés

Le but global de cette initiative pancanadienne est de positionner le Canada pour permettre l'application rapide des découvertes épigénétiques à des méthodes diagnostiques et la création de produits thérapeutiques pouvant améliorer la santé. En appuyant la recherche en épigénétique et en en appliquant les résultats à l'échelle nationale, le CCREES exploite son vaste potentiel pour la réalisation d'importantes percées dans la compréhension des origines de la santé, et également dans l'étiologie, le traitement et la prévention de nombreuses maladies chroniques au Canada. Voici certains des objectifs précis du Consortium :

  • établir une plateforme nationale en épigénétique qui servira de ressource essentielle pour la génération d'épigénomes de référence et qui coordonnera les efforts nationaux de recherche épigénomique;
  • appliquer les découvertes de la recherche épigénétique dans la pratique clinique par l'appui de la recherche épigénétique à grande échelle, y compris la création d'outils moléculaires en vue d'applications diagnostiques et thérapeutiques à divers troubles complexes;
  • positionner les chercheurs, les cliniciens et les responsables des politiques canadiens à l'avant-scène de la science épigénétique, et de son application dans des produits de soins de santé, en jouant un rôle directeur au sein du CIEH et dans d'autres initiatives internationales en épigénétique.
Partenaires

Le CCREES est codirigé par l'Institut des neurosciences, de la santé mentale et des toxicomanies, l'Institut de génétique et l'Institut du cancer, en partenariat avec la plupart des autres instituts des IRSC.

Le Consortium compte parmi ses partenaires Génome Canada, Genome BC (en anglais seulement), Génome Québec et le Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS).

Le CCREES cherche principalement à favoriser les collaborations de recherche internationale en épigénétique et épigénomique. Par son entremise, les IRSC ont été des membres fondateurs du Consortium international de l'épigénome humain (CIEH) (en anglais seulement). Le CIEH est un consortium mondial constitué de bailleurs de fonds et de chercheurs spécialisés en épigénomique humaine, avec comme objectif premier de fournir au milieu de la recherche mondiale des ensembles exhaustifs de cartes de référence épigénomiques touchant la santé et la maladie. En établissant des normes de qualité et en offrant des mécanismes de communication efficaces, le CCREES fait la promotion d'un échange rapide des données et permet de réduire les chevauchements entre projets de recherche.

Pour réaliser ses objectifs, le CCREES a lancé un Portail de données (en anglais seulement) en 2014. Ce portail peut servir à chercher, consulter et télécharger toutes les données diffusées par les responsables des projets associés au Consortium. Concrètement, il a été mis en œuvre à l'intention du CIEH par un des centres de coordination des données épigénomiques (CCDE) du CCREES, établi au Centre d'innovation Génome Québec et Université McGill (en anglais seulment). Ce CCDE est financé par les IRSC et Génome Québec, avec l'aide de Génome Canada.Calcul Canada et CANARIE sont à l'origine de l'infrastructure informatique et de réseau, ainsi que d'une partie du développement de logiciels.

Une fonction secondaire du CIEH consiste à soutenir des projets cherchant à améliorer les technologies épigénomiques et les méthodes d'analyse. Le CCDE du CCREES établi à Vancouver au BC Cancer Agency Genome Sciences Centre (en anglais seulement) a mis au point une série d'outils de visualisation et d'analyse de données novateurs ainsi qu'un ensemble de normes et de protocoles approuvés par le CIEH et pouvant être téléchargés (en anglais seulement) par les acteurs du milieu de la recherche. Ce CCDE est financé par les IRSC et Genome BC (en anglais seulement).

Le CIEH cherche en outre à faciliter les échanges de recherche entre les membres, notamment par la conclusion d'ententes bilatérales et multilatérales visant à étudier le rôle de la régulation épigénétique dans le développement des maladies ainsi que les interactions plus larges gènes-environnement dans le domaine de la santé humaine. En 2012, les IRSC et l'Agence japonaise des sciences et de la technologie (en anglais et en japonais seulement) ont lancé une possibilité de financement bilatérale sur l'épigénétique des cellules souches. En 2014, une possibilité de financement de subventions d'équipe multilatérale sur l'épigénomique des maladies complexes a été créée conjointement par les IRSC, le FRQS, l'Agence nationale de la recherche (ANR) et le Ministère fédéral allemand de l'éducation et de la recherché (en allemand et en anglais seulement). Veuillez consulter la page Financement du CCREES pour plus d'informations.

Pour toute question à ce sujet, n'hésitez pas à communiquer avec nous.

Nouvelles
Nouvelles Date

À venir : 9e congrès canadien sur l’épigénétique, du 13 au 16 novembre 2023 au centre Banff (Banff, Alberta)

2023

Le CCREES est heureux de s’associer à l’International Human Epigenome Consortium (IHEC) pour accueillir la réunion annuelle de l’IHEC et la 8e conférence canadienne sur l’épigénétique (en anglais seulement) du 4 au 7 octobre 2022 à l’Estérel, Québec.

2022

Annonce : Le Canada et le Japon s'unissent pour aider les chercheurs en début de carrière à faire progresser la recherche en épigénétique

L’assemblée générale annuelle 2020 du CCREES (en anglais seulement) est reportée du 2 au 5 novembre 2021 à l’Estérel, Québec

2021

Annonce : Chercheurs en début de carrière – Collaboration de l’ARDM et des IRSC en recherche pour le perfectionnement des technologies épigénétiques

2020

Le réseau du CCREES annonce le lancement du Epigenome Profiling – Community Access Program (en anglais seulement) (échéance : 31 mai 2018)

La cinquième Conférence canadienne sur l’épigénétique aura lieu du 30 septembre au 3 octobre 2018 à l’hôtel Estérel, Estérel (Québec)

Le symposium-bilan Canada-Japon sur l’épigénétique des cellules souches, qui s’est tenu à Tokyo (Japon) le 13 mars 2018, visait à passer en revue le travail réalisé dans le cadre de l’initiative Épigénétique des cellules sources Canada-Japon dans le but de faciliter l’application des résultats de la recherche ainsi que l’évaluation finale. Vous trouverez plus de détails sur les équipes financées en ligne.

2018

En 2013, le CIEH tient une réunion annuelle fructueuse dans la capitale allemande (en anglais seulement) (2013-11)

Il est possible de visionner les vidéos des présentations de Science Day.

2013

En 2012, réunion annuelle du CIEH à Séoul, en Corée du Sud (en anglais seulement) (2012-10)

2012

Financement

Concours précédents

Possibilité de financement Concours Décision de financement
Subvention d'équipe : Équipes Canada-Japon du CCREES pour le perfectionnement des technologies épigénétiques (Collaboration de l’ARDM et des IRSC en recherche pour le perfectionnement des technologies épigénétiques) 202010CJP Décisions de financement
Subvention de fonctionnement : CCREES (épigénétique) 2019 201904EPT Décisions de financement
Subvention de fonctionnement : Application clinique de l’épigénétique 201810ECT Décisions de financement
Subvention d'équipe : Nutrition et épigénome (Appel de propositions de recherche transnationales de l’ERA-HDHL sur la nutrition et l’épigénome) 201804NTE Décisions de financement
Subvention d'équipe : CCREES, Phase II 201802TGH Décisions de financement
Autre : La génomique et la santé de précision (Concours 2017 : projets de recherche appliquée à grande échelle en génomique et santé de précision) 201710GP1 Décisions de financement
Subvention de fonctionnement : Subvention de promotion de l'impact : CCREES phase II 201708IGH Décisions de financement
Subvention d'équipe : Projet concerté et transformateur du programme 4D Nucleome 201702NTC Décisions de financement
Autre : CCREES phase 2 : renouvellement des centres de plateforme 201612CEE Décisions de financement
Subvention de fonctionnement : CCREES (épigénomique) : Consortium de recherche 201501EGT
201505EPT
Décisions de financement
Appel à projets internationaux France-Allemagne-Canada sur l'épigénomique des maladies complexes   Décisions de financement
Bourse de recherche : annonce de priorités de l'automne 2013 (Épigénétique) 201311MFE Décisions de financement
Bourse de recherche : annonce de priorités de l'hiver 2013 (Épigénétique) 201302MFE Décisions de financement
Bourse de recherche : annonce de priorités de l'automne 2012 (Épigénétique) 201210MFE Décisions de financement
Subvention d'équipe : Équipes Canada-Japon du CCREES en épigénétique des cellules souches 201208EPS Décisions de financement
Subvention d'équipe du CCREES 201205TEL
201212TEC
Décisions de financement
Bourse de recherche : annonce de priorités de l'hiver 2012 (Épigénétique) 201202MFE Décisions de financement
Bourse de recherche : Annonce de priorités en épigénétique, automne 2011 201110MFE Décisions de financement
Plateforme en épigénomique du CCREES 201111EPL Décisions de financement
Décisions de financement
Subvention Catalyseur du CCREES 201111CAP Décisions de financement
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